马渐新，博士，海外特聘教授（兼职），博士生导师。1999年于中国农业科学院作物品种资源研究所（现作物科学研究所）获农学博士学位，系全国优秀百篇博士论文获得者。2000-2005年先后在美国普渡大学生物系及佐治亚大学遗传系从事植物基因组学博士后研究。2005-2007年先后任普渡大学研究遗传学家（Research Geneticist）和研究助理教授，自2007年8月先后受聘为普渡大学农学系助理教授（2007-2011）、副教授（2011-2015）、教授（2015-至今），兼普渡大学植物生物学研究中心教授。曾获普渡大学成功种子奖、大学学者奖及农业研究奖。现任美国遗传学会期刊G3: Genes, Genomes, Genetics及美国作物学会期刊Plant Genome副编辑（Associate Editor)，Frontier in Plant Genetics and Genomics审稿编辑。中国油料作物学报《Oil Crop Sciences》副主编，作物学报Crop Journal及大豆科学（Soybean Science)编委。兼任国际动植物基因组大会转座子分会主席、美国国家科学基金、美国农业部NIFA科研基金、美国-以色列双边研究基金、及中国国家自然科学基金等评委。
研究方向与领域：
主要从事植物比较、功能与进化基因组学研究及豆类作物应用遗传学研究。
主要研究成果：
发表80余篇期刊文章及书本章节，其中包括：3篇《Nature》（1篇第四作者）、1篇《Science》（作者之一）、1篇《Nature Genetics》（通讯作者）、1篇《Nature Biotechnology》（并列第一作者）、1篇《Nature Plants》（通讯作者）、一篇《Nature Communications》（作者之一）、7篇《Genome Research》（1篇通讯和3篇第一作者）、6篇《PNAS》（1篇通讯和2篇第一作者）、7篇《PlantCell》（均为通讯作者）、1篇《PLoS Genetics》（通讯作者）、2篇《Current Opinion in Plant Biology》（1篇通讯作者）、1篇《Trends in Genetics》（第一作者）、2篇《Plant Physiology》(1篇通讯作者)、6篇《Plant Journal》（3篇通讯作者）、3篇《Genetics》(2篇第一作者)等。
近年代表性论文：
1.Zhang, D.#, Sun, L.#, Li, S.#, Wang, W., Swarm, S.A., Li, L., Ding, Y. Wang, X., Tang, X., Zhang, Z., Tian, Z., Cai, C., Brown, P.J., Nelson, R.L., and Ma., J.*2018. Selection for seed coat shininess elevates seed oil content under soybean domestication.Nature Plants,4: 30-35.
2.Zhao, M., Zhang, B., Lisch, D.*, and Ma, J.* 2017. Patterns and Consequences of Subgenome Differentiation Provide Insights into the Nature of Paleopolyploidy in Plants.Plant Cell, 29: 2974-2994.
3.Liu, Y.#, Zhang, D.#, Ping, J., Li, S., Chen, Z., and Ma, J.* 2016. Innovation of a regulatory mechanism modulating semi-determinate stem growth through artificial selection in soybean.PLOS Genet., 12: e1005818.
4.Sun, L.#, Miao, Z.#, Cai, C.#, Zhang, D., Zhao, M., Wu, Y., Zhang, X., Swarm., S.A., Zhou, L., Zhang, Z.J., Nelson, R.L., and Ma, J.* 2015. GmHs1-1, encoding a calcineurin-like protein, controls hard-seededness in soybean.Nat. Genet.47: 939-943.
5.Zhao, M., Meyers, B.C., Cai, C., Xu, W., and Ma, J.* 2015. Evolutionary Patterns and Co-evolutionary Consequences of MIRNA Genes and MicroRNA Targets Triggered by Multiple Mechanisms of Genomic Duplications in Soybean.Plant Cell27: 546-562.
6.Wang, Z., Zhou, Z., Liu, Y ., Shen, Y., Liu, T., Ji, Li, Q., Wu, M., Ma, J.*, and Tian, Z.* 2015. Functional evolution of phosphatidylethanolamine-binding proteins (PEBPs) in soybean and Arabidopsis.Plant Cell26: 996-1008.
7.Li, Y.#, Zhou, G.#, Ma, J.#, Jiang, W., (29 more authors) Li, R.*, and Qiu, L.*2014.De novoassembly of soybean wild relatives for pan-genome analysis of diversity and agronomic traits.Nat. Biotech. 32: 1045-1054
8.Ping, J.#,Liu, Y.#, Sun, L.#, Zhao, M., Lin, F., Sui, Y., She, M., Nelson, R.L., Clemente, T., Specht, J., and Ma, J*. 2014.Dt2is a gain-of-function MADS-domain factor gene that specifies semi-determinacy in soybean.Plant Cell26: 2831-2842.
9.Tian, Z., Zhao, M., She, M., Du, J., Cannon, S.B., Liu, X., Xu, X., Qi, X., Li, M.W., Lam, H.M., and Ma, J.*2012. Genome-wide characterization of nonreference transposons reveals evolutionary propensities of transposons in soybean.Plant Cell24: 4422-4436.
10.Du, J., Tian, Z., Sui, Y., Zhao, M., Song, Q., Cannon, S.B., Cregan, P., and Ma, J.*2012. Pericentromeric effects shape the patterns of divergence, retention, and expression of duplicated genes in the paleopolyploid soybean (Glycine max(L.).Plant Cell24: 21-32.
11.Tian, Z., Wang, X., Lee, R., Li, Y., Specht, J., Nelson, R., McClean, P*, Qiu, L.*, and Ma. J.*2010. Artificial selection for determinate growth habit in soybean.Proc. Natl. Acad. Sci. USA107: 8563-8568.
12.Schmutz, J., Cannon, S.B., Schlueter, J., Ma, J., ... Du, J., Tian, Z., Zhu. L., (20 more authors), Rokhsar, D., R.C. Shoemaker, R.C., Jackson, S.A.*2010. Genome sequence of the paleopolyploid soybean (Glycine max(L.) Merr.).Nature463: 178-183.
13.Du, J., Tian, Z., Schmutz, J., Bowen, N.J., Shoemaker, R.C., and Ma, J.*2010. Bifurcation and enhancement of autonomous-nonautonomous retrotransposon partnership through LTR swapping in soybean.Plant Cell22: 48-61.
14.Tian, Z.#, Rizzon, C.#, Du, J., Zhu, L., Bennetzen, J.L., Jackson, S.A.*, Gaut, B. *, and Ma, J.*2009. Do genetic recombination and gene density shape the pattern of DNA elimination in rice LTR-retrotransposons?Genome Res. 19: 2221-2230.
联系信息:
通讯地址：det365娱乐场所官方网
课题组联系地址：山东农业大学创新大楼204室
备注：
本课题组招收植物基因组学与作物遗传育种方向硕士、博士研究生、博士后及其他研究人员，欢迎有志于该研究领域的学生和研究人员加盟。